Cubase SX 3 ist die größere Version, dafür aber älter. Da könntest Du später evtl. günstig auf Cubase 5 upgraden, wenn Du wieder Geld hast.
LE 4 ist die kleinste Version als Hardwarebeigabe, ist zwar neuer als SX 3, aber auch sehr eingeschränkt. z. B. gibt es kein VSTi-Rack, Du musst multitimbrale VST-Instrumente immer mehrfach öffnen.
Ich würde Dir eher zu SX 3 raten, wg der Upgrademöglichkeit. Zum Lernen des Cubse-Workflows kannst Du sicher beide gut nutzen.