Okay, wenn ich das richtig verstehe, geht es dir eigentlich um den Sound bei der Aufnahme, nicht um deinen live Sound (Proberaum, Bühne)?
Auf der Aufnahme sind wummernde Bässe bei den Gitarren eher ein No-Go, weil die sich zu sehr mit den Frequenzen des Bass überlagern. Ich würde die Bässe für die Aufnahme etwas zurück drehen oder generell mit einem Low-Cut arbeiten.
Ansonsten könntet ihr doch mal probieren, wie dein Amp an der Box des anderen Gitarristen klingt oder nehmt ihr euer Zeug direkt live auf oder wie darf man das verstehen? Falls ihr eure Probe live mitschneidet und nicht alles mikrofoniert, kommt es auch auf die Positionierung der Amps und des Aufnahmegeräts zu den Amps an. Da müsst ihr ein bisschen rumprobieren, wo der beste Spot ist.