Das tue ich auch (Gitarre nach jedem Akkord zu wechseln), aber nicht aus hygienischen Gründen. Ich finde einfach, dass bestimmte Hölzer für bestimmte Akkorde besser klingen. Ein C Major klingt toll auf Erle, aber ein E Minor klingt viiiel besser auf Mahagony. Für A Minor bevorzuge ich auch Mahagony, aber mit Ahorn Decke...
Ich experimentiere gerade mit Gitarrenwechsel beim Alternate Picking. Eine Strat für Downstrokes und Wechsel auf Tele für Upstrokes. Überlege gerade mir eine Double-Neck Gitarre zu holen (Strat + Tele), damit ich nicht mehr wechseln muss. Frage mich, ob ich mit dem Neck Skipping genauso gut durchkomme.
