OK
Was ich an deiner Stelle tun würde, wenn du es nicht eh schon gemacht hast, ist einen frischen Satz 9er Saiten aufspannen, auf Standard E stimmen (Auslieferungszustand) und schauen wie die Gitarre klingt. Oder, spann nur die G-Saite auf (mit nur einer Feder beim FR), spann sie auf einer anderen Stelle auf, versuch eine dickere/dünnere Saite auf dem Platz der G-Saite und schau, ob bei denen das selbe auftritt. Spiel auch mit unterschiedlichen Stimmungen der Saite. Hast du die Federn des FR schon mal kontrolliert? Vielleicht berühren die irgendwo den Korpus und dämpfen evtl etwas ab? Zieh nochmal alle Schrauben des FR fest (Saitenreiter, Klemmblöcke, Federblock, Klemmsattel)..........
Wahrscheinlich hast du vieles davon eh schon ausprobiert, aber das Problem muss doch an irgendwas festzumachen sein. Es kann doch nur an der Hardware oder den Saiten liegen.
Interessant wäre auch eine Aufnahme jeder Saiten lose angespielt clean und verzerrt.